安徽省卫生厅是主管卫生工作的省人民政府组成部门，根据《中共中央办公厅、国务院办公厅关于印发的通知》（厅字〔2009〕3号）批准设置。

按照安徽省政府办公厅《关于印发安徽省卫生厅主要职责内设机构和人员编制规定的通知》（皖政办〔2009〕99号）规定，省卫生厅机关行政编制为86名。其中：厅长1名、副厅长4名，纪检组长1名，省中医药管理局局长1名（高配副厅级）；处级领导职数27名。