牙发育异常是指牙齿在生长发育过程中出现的形态、结构、数目和萌出等方面的异常，其病因较为复杂，主要包括以下几类：

遗传因素在牙发育异常中起着重要作用。许多牙发育异常具有明显的家族遗传倾向，某些基因突变或染色体异常可直接影响牙齿发育的各个阶段。例如，遗传性牙本质发育不全是一种常染色体显性遗传病，患者的牙本质结构和矿化出现异常，导致牙齿颜色改变、易磨损等症状。

环境因素也对牙发育有显著影响。在胎儿期，母亲的身体状况至关重要。如果母亲在孕期患有严重的全身性疾病，如糖尿病、甲状腺功能亢进或低下等，可能会影响胎儿牙齿的正常发育。此外，孕期母亲感染风疹病毒、梅毒螺旋体等病原体，也可能导致胎儿牙釉质发育不全。

儿童出生后的营养状况对牙齿发育影响很大。维生素D、钙、磷等营养素缺乏会影响牙齿的矿化过程。例如，维生素D缺乏会导致钙、磷吸收和利用障碍，引起牙釉质和牙本质发育不良。长期的全身性疾病，如慢性腹泻、结核病等，会影响儿童的营养吸收和代谢，进而影响牙齿发育。

药物因素也是导致牙发育异常的原因之一。在牙齿发育期间，若儿童使用了某些药物，如四环素类药物，可与牙齿中的钙结合，形成四环素钙复合物，导致牙齿变色和牙釉质发育不全。另外，过量使用氟化物也会影响牙釉质的正常发育，出现氟斑牙。

外伤和局部感染同样会影响牙齿发育。乳牙外伤可能影响下方恒牙胚的发育，导致恒牙萌出异常或形态结构异常。乳牙根尖周感染也可能波及恒牙胚，造成恒牙发育缺陷。

综上所述，牙发育异常是多种因素共同作用的结果，了解这些病因有助于采取相应的预防和治疗措施。