常用的口腔流行病学研究方法主要有描述性流行病学、分析性流行病学和实验流行病学。

描述性流行病学是流行病学中最常用的一种，它又包括横断面研究、纵向研究和常规资料分析。横断面研究又称现况调查，是在特定时间范围内，对特定人群中的疾病或健康状况以及相关因素进行调查，比如了解某地区人群的龋病患病情况，能为疾病的防治提供基础资料，确定高危人群和流行特征。纵向研究是对一组人群定期随访，观察疾病或健康状况的动态变化，例如观察儿童乳牙列到恒牙列的龋病发展情况，有助于深入了解疾病的自然发展过程。常规资料分析则是对已有的记录资料进行分析，像医院的病历、疾病报告等，可从中获取疾病的分布和变化趋势等信息。

分析性流行病学包括病例 - 对照研究和队列研究。病例 - 对照研究是选择患有某病和未患该病的人群，分别调查其既往暴露于某个（些）危险因素的情况及程度，以判断暴露危险因素与某病有无关联及其关联程度大小。比如研究吸烟与口腔癌的关系，通过对比口腔癌患者和非患者的吸烟情况来分析两者联系。队列研究是将特定人群按是否暴露于某因素分为暴露组和非暴露组，随访观察一定时间，比较两组人群某种疾病的发病率或死亡率，从而判断暴露因素与疾病的关联。例如观察长期使用某种口腔护理产品的人群和未使用人群的牙周病发病情况。

实验流行病学是将研究对象随机分为实验组和对照组，给实验组施加干预措施，对照组不施加或施加安慰剂，然后随访观察两组人群疾病的发生情况，以评价干预措施的效果。比如研究某种新型牙膏对预防龋病的效果，通过对实验组使用该牙膏，对照组使用普通牙膏，一段时间后对比两组的龋病发生率。

这些口腔流行病学研究方法各有特点和用途，在口腔疾病的病因探索、防治效果评价等方面发挥着重要作用。