缺血再灌注损伤是指在缺血基础上恢复血流后组织损伤反而加重，甚至发生不可逆性损伤的现象，它会对机体多个方面产生不良影响。

在器官功能方面，缺血再灌注损伤会严重损害心、脑、肾等重要器官。对于心脏，再灌注损伤可导致心肌顿抑，使心肌收缩功能明显降低，心输出量减少，还可能引发心律失常，如室性心动过速、心室颤动等，严重时可危及生命。在脑部，会造成脑功能障碍，患者可能出现认知功能下降、意识障碍、头痛、呕吐等症状，甚至可能发展为脑梗死、脑出血等严重疾病，影响神经系统的正常功能，导致肢体运动障碍、感觉障碍等后遗症。肾脏发生缺血再灌注损伤时，会影响其排泄和内分泌功能，出现少尿或无尿、氮质血症等急性肾功能衰竭的表现。

在细胞代谢方面，缺血再灌注过程中，细胞内的代谢紊乱会进一步加剧。由于氧自由基的大量产生，会攻击细胞膜上的脂质、蛋白质和核酸等生物大分子，破坏细胞膜的结构和功能，导致细胞内离子失衡，如细胞内钙超载，这又会激活一系列钙依赖性酶，进一步损伤细胞。同时，线粒体的功能也会受到影响，能量代谢障碍加重，ATP生成减少，细胞的正常生理活动无法维持。

在组织学结构上，缺血再灌注损伤会引起组织炎症反应。大量炎症细胞浸润，释放多种炎症介质，导致组织水肿、出血和坏死。例如在心肌组织中，可见心肌细胞肿胀、变性、坏死，间质充血、水肿；在肝脏组织中，会出现肝细胞的损伤和肝血窦的淤血等病理变化。

此外，缺血再灌注损伤还会对全身产生影响，引发全身炎症反应综合征，导致多器官功能障碍综合征，使病情更加复杂和严重，增加患者的死亡率。