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2017年12月14湖北武汉基因组转录组生物信息学数据分析培训班

2017-11-16 14:06关注收藏已关注收藏】 【在线报名参会
会议日期 2017-12-14至 2017-12-18
会议地点 湖北武汉
会议学科 科研/教育
主办单位 北京中科云畅应用技术研究院
学分情况

章节  内 容 
生物信息学介绍  生物信息学介绍与前沿技术动态 
序列的比对  1、全局比对 Clustalw,Muscle,Hmmer
2、局部比对 Blast, Sim4,Genewise
3、序列比对算法分析 


基因组/基因注释分析 
1、新一代测序技术原理和数据处理介绍
2、基因组拼接与组装
基因组de novo组装方法
重复序列分析技术
3、RNA分析
tRNA,rRNA,microRNA,snoRNA
RNA干扰,SiRNA预测技术
4、基因预测
原核:Glimmer,真核:Genescan, Augustus
5、 基因功能注释及常用的数据库介绍 
基因组学研究概述
  
1、structural genomics: 结构基因组学
2、functional genomics: 功能基因组学
3、Drug discovery: 药物研发
4、Personalized medicine:个性化、精细医疗
  
DNA测序技术-转录组分析的进化  1、第一代测序技术:Sanger测序原理
2、第二代测序技术:Illumina,454, Ion Torrent原理
3、第三代测序技术:PacBio, Hellicos原理
4、第四代测序技术: Oxford NanoPore原理
5、其他技术Hybridization based methods (NabSys) 
Experimental procedure for transcriptomic analysis  Introduction
Number of duplications
Sequencing coverage
Transcriptomic analysis using NGS (RNA-Seq)
Transcriptomic analysis using PacBio (Iso-Seq)
IsoSeq Experimental design 
Data analysis (part 1):data pre-processing
  
evaluation of data quality 数据分析
Data format,fasta,fastq,quality value,gff3 Data cleanup
Quality filter, trimmer, clipper
  
Data analysis (part 2):reference free analyses(无参转录组分析)  Gene discovery
Trinity de novo transcriptome assembly
Analysis of Differential Expressed Gene (DEGs)
Abundance estimation using RSEM
Differential expression analysis using EdgeR
Explore the results (cummerbund)
MA plot, Volcano plot, False Discovery Rate (FDR)
hierarchical two-way clustering, pairwise sample-distance, gene expression profiles.
  
使用R语言进行生物信息学相关的分析  使用R语言相关的包对转录组等组学的高通量测序数据进行差异表达、富集分析等。
生物信息学专业图KEGG、GO等的绘制方法与运用R语言进行实现 
基因组可视化软件circos的使用 
使用circos绘制基因组圈图 
生物信息学专业常用工具及绘图方法  应用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换;
学BioEdit、WeGO等常用生物学专业软件的图表及格式转换 

报名办法及费用:

每人¥4300元(含报名费、资料费、培训费、考试费),住宿可统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请传真至会务处。

地点:湖北 武汉

联系人:李永军

联系电话:18513478760

邮箱:3263004853@qq.com

祝:工作顺利,身体健康!!!

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