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2016举办“生物信息学最新技术”暨“生物信息绘图技术与实践”高级培训班

2016-08-31 17:07关注收藏已关注收藏】 【在线报名参会
会议日期
会议地点
会议学科
主办单位
学分情况

  各有关单位:

  生物信息实验中的海量离散数据蕴含着各种显著或潜在的规律和特征,这些规律或特征通常被淹没在随机信号和实验误差之中。将数据变为直观的图表,不仅可以形象化的展现数据中的这些规律,还能表现出数据之间存在着各种直接或间接的联系(如包含、延伸、对照、线性等)。因此生物信息绘图技术是在生物研究中非常重要的工具,能够大幅提高研究者的科研效率,在实验数据分析、科技论文写作中不可或缺。生物信息绘图软件非常多,功能也各有不同,为了满足广大生物科技研究人员的迫切需要,北京海淀中科计算技术转移中心(中科院计算所技术转移中心)举办“生物信息学最新技术”暨“生物信息绘图技术与实践”高级培训班,并由北京嘉诚永恒科技有限公司具体承办。“智能信息处理技术”为人力资源与社会保障部中国科学院北京分院国家级专业技术人员继续教育基地培训点培训项目,“生物信息”为智能信息处理技术系列培训项目之一。具体事宜通知如下:

  一、科技论文绘图概论

  科技期刊对绘图(figure)的具体要求和各种图片格式及应用场景介绍;根据具体要求联合应用Photoshop和Illustrator进行单张图片的调整、整合和输出;图片细节的调整和美化,包括线条的快速调整、标尺的制作、文字的编排等;利用Mindmanager和亿图图示专家等专业软件进行 “思路图”和科研项目流程图的绘制。

  二、R语言基础

  R语言简介、功能及基本语法介绍

  三、R语言功能及应用案例

  R语言简介、功能及基本语法介绍及实际操作

  1)(散点图——点线混合图、并列散点图、坐标对数化

  2)条形图-标准条形图、推积条形图、邻接条形图、Error Bar    形

  3)图文氏图

  4)饼图——二维饼图、三维饼图

  5)盒形图——(箱线图)

  6)经验分布图

  7)频率直方图

  8)及热图(三种热图不同作图方法)等的绘制

  四、ggplot2的使用

  掌握ggplot2绘图相关命令,以及常见图表(条形图,折线图,散点图,直方图以及密度图等。添加注释,分页以及配色,坐标轴调整)

  五、R在统计学中的应用

  使用R做一些常用的统计分析。假设检验;回归分析、方差分析;主成分分析、聚类分析等等(以生物、医学和生态相关内容为例)

  六、使用R语言进行生物信息学相关的分析

  使用R语言相关的包对转录组等组学的高通量测序数据进行差异表达、富集分析等。

  生物信息学专业图KEGG、GO等的绘制方法与运用R语言进行实现

  七、进化分析及作图

  基本进化树构建方法(MEGA) 模型评估(MEGA) 进化树注释(Evolview)

  八、科技论文绘图及修图基础

  科技论文图表要求;

  绘图基础知识、图文件类型、来源与绘制方法介绍;

  常规绘图与实现方法及软件学习(powerpoint、visio、adobe illustrator等)。

  九、生物信息学专业常用工具及绘图方法

  运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换;

  学BioEdit、WeGO等常用生物学专业软件的图表及格式转换。

  十、数据分析绘图工具origin的使用

  使用origin软件进行图形绘制、编辑以及曲线拟合等数据分析操作

  十一、基因组可视化软件circos的使用

  使用circos绘制基因组圈图

  时间地点:  2016年9月22日—9月26日       北京大学

  (时间安排:第1天报到,授课4天)

  联系人/电话:张琦   17310133545   010-58032566

  Email:hdzkyjsjs@163.com

  报名办法及费用:

  每人¥4800元(含报名费、培训费、资料费、考试费、证书相关费用)食宿统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请传真或邮件至会务处。

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