一是与《传统医学师承和确有专长人员医师资格考核考试办法》（卫生部令第52号）的衔接。卫生部令第52号继续实施，保留师承和确有专长人员通过国家统一考试取得医师资格的原渠道不变。《暂行办法》实施前已按照卫生部令第52号规定取得传统医学师承出师证书和传统医学医术确有专长证书的，可申请参加国家医师资格考试，也可申请参加中医医术确有专长人员医师资格考核（师承出师人员需继续跟师学习满2年）。

二是与《关于做好中医药一技之长人员纳入乡村医生管理工作的通知》的衔接。已纳入乡村医生管理的中医药一技之长人员可以申请参加考核，也可继续以乡村医生身份执业。《暂行办法》发布后，《关于做好中医药一技之长人员纳入乡村医生管理工作的通知》（国中医药医政发〔2013〕17号）同时废止。