局部用药治疗牙周病需要遵循以下原则：

首先是遵循适应证原则。局部用药主要适用于以下情况：对于一些轻度牙周炎，作为辅助治疗手段；对于某些全身疾病患者，不能耐受或不适合进行复杂的牙周手术时，可采用局部用药控制炎症；在牙周基础治疗后，仍存在个别部位炎症难以控制时，也可局部用药。例如，对于患有心血管疾病等全身性疾病的患者，局部用药可以减少全身用药可能带来的不良反应。

其次是药物选择的针对性原则。不同类型的牙周病可能需要不同的药物。对于厌氧菌感染为主的牙周炎，可选择甲硝唑等抗厌氧菌药物；对于有革兰氏阳性菌感染的情况，可选用阿莫西林等药物。同时，还应考虑药物的剂型，如漱口水可用于日常口腔清洁和辅助控制炎症，凝胶剂可直接作用于牙周袋内，增强局部药物浓度。

再者是剂量和疗程的合理性原则。要根据病情的严重程度和患者的个体差异，合理确定药物的剂量和使用疗程。剂量过小可能无法达到治疗效果，而剂量过大则可能增加不良反应的发生风险。例如，使用抗生素进行局部治疗时，一般需要连续使用一定的天数，以确保彻底杀灭病原菌，但也不能过长时间使用，以免引起耐药菌的产生。

另外，联合用药的科学性原则也很重要。在一些情况下，单一药物可能无法有效控制病情，此时需要联合使用不同作用机制的药物。但联合用药时要注意药物之间的相互作用，避免不良反应的发生。比如，将抗厌氧菌药物和广谱抗生素联合使用时，要充分考虑它们的协同作用和可能出现的副作用。

最后是与其他治疗方法相结合的原则。局部用药不能替代牙周基础治疗，如洁治、刮治等。应在彻底清除牙菌斑、牙石等局部刺激因素的基础上，合理使用局部药物，以提高治疗效果。同时，还应指导患者保持良好的口腔卫生习惯，定期进行复查和维护，以巩固治疗成果，防止牙周病的复发。

总之，局部用药治疗牙周病需要综合考虑多方面因素，遵循上述原则，以达到最佳的治疗效果。