口腔生物化学的研究对象主要围绕口腔内的各种生物分子、细胞以及它们之间的相互作用和所涉及的化学反应过程。

从生物分子层面来看，蛋白质是重要的研究对象之一。口腔中的唾液含有多种蛋白质，如淀粉酶、溶菌酶等。淀粉酶参与食物中淀粉的初步消化，而溶菌酶具有抗菌作用，能保护口腔免受细菌感染。此外，牙齿和牙周组织中的胶原蛋白等蛋白质，对于维持牙齿和牙周组织的结构和功能至关重要。核酸在口腔细胞中也有重要意义，它携带遗传信息，控制细胞的生长、分化和功能。研究核酸有助于了解口腔疾病的发生机制，如口腔癌的发生可能与基因突变等核酸水平的变化有关。

糖类在口腔生物化学中也备受关注。口腔中的细菌可以利用糖类进行代谢，产生酸性物质，这些酸性物质会腐蚀牙齿，导致龋齿的发生。同时，一些糖蛋白和糖脂在细胞识别、信号传导等过程中发挥着重要作用。

脂类同样是研究对象。细胞膜主要由脂类构成，它对于维持细胞的正常结构和功能起着关键作用。口腔中的一些细菌也会合成特定的脂类物质，这些物质可能与细菌的致病性相关。

从细胞角度来说，口腔中的上皮细胞、成纤维细胞、成骨细胞等都是研究的重点。上皮细胞覆盖在口腔黏膜表面，起到保护作用，其代谢和更新过程与口腔黏膜疾病密切相关。成纤维细胞参与牙周组织的修复和再生，研究其生物学特性有助于开发促进牙周组织修复的治疗方法。成骨细胞则与牙槽骨的生长和改建有关，对于正畸治疗等具有重要意义。

此外，口腔生物化学还研究口腔内的微生态环境。口腔中存在着大量的微生物，它们之间以及与宿主细胞之间存在着复杂的相互作用。这些微生物的代谢活动会影响口腔的酸碱平衡、免疫反应等，进而影响口腔健康。例如，某些细菌的过度生长可能导致口臭、牙周炎等疾病。

综上所述，口腔生物化学的研究对象涵盖了口腔内的生物分子、细胞以及微生态环境等多个方面，通过对这些对象的研究，可以深入了解口腔生理和病理过程，为口腔疾病的诊断、治疗和预防提供理论基础。