根分叉病变是指牙周炎的病变波及多根牙的根分叉区，可发生于任何类型的牙周炎。其病因主要包括以下几个方面。

菌斑微生物是引起根分叉病变的始动因素。牙菌斑内含有大量的细菌及其毒性产物，它们会持续刺激牙周组织，引发炎症反应。当菌斑长期堆积在根分叉区域时，会破坏牙周膜和牙槽骨，导致根分叉病变的发生和发展。而且，根分叉处的解剖形态特殊，使得菌斑更容易在此处积聚，增加了感染的风险。

咬合创伤也是重要病因之一。过大的咬合力量会使牙齿承受的应力分布不均，根分叉区受到的应力集中，从而损伤牙周组织。长期的咬合创伤会加速牙槽骨的吸收和牙周纤维的破坏，使根分叉区的支持组织逐渐丧失，进而引发根分叉病变。

牙根的解剖形态对根分叉病变的发生也有影响。根柱的长度、根分叉开口的宽度和分叉角度等因素都与根分叉病变的易感性有关。根柱较短、根分叉开口较窄、分叉角度较小的牙齿，根分叉区的菌斑清除难度较大，而且一旦发生炎症，病变容易向根分叉区蔓延。

此外，龋病、牙髓病等也可能影响根分叉区。如果龋坏穿通髓室底，细菌及其毒素可直接感染根分叉区的牙周组织；牙髓治疗过程中，若根管侧穿或髓室底穿孔未得到及时正确的处理，也会导致根分叉区的炎症和破坏。同时，不良修复体如边缘不密合、悬突等，会促进菌斑的堆积，刺激牙龈和牙周组织，增加根分叉病变的发生几率。全身因素如糖尿病等也会影响牙周组织的正常代谢和修复能力，使患者更容易发生根分叉病变。