牙本质与牙髓在组织结构和生理功能上关系密切，二者相互作用，共同维持牙齿的健康。

从胚胎发育角度来看，牙本质和牙髓都来源于外胚间叶组织，在发育过程中相互依存、协同发展。成牙本质细胞是形成牙本质的主要细胞，它们位于牙髓的最外层，其突起伸入牙本质小管内。这种结构上的联系为二者的相互作用提供了基础。

在生理状态下，牙髓为牙本质提供营养。牙髓内含有丰富的血管和神经，通过成牙本质细胞突起与牙本质进行物质交换，为牙本质的代谢和矿化提供必要的营养物质和氧气，保证牙本质的正常结构和功能。同时，牙本质对牙髓起到保护作用，它作为一种硬组织，能够缓冲外界刺激，减少外界因素对牙髓的直接损伤。

当牙本质受到外界刺激时，如龋病、磨损、酸蚀等，会引发一系列的反应。首先，成牙本质细胞会受到刺激，通过细胞突起将刺激信号传导至牙髓。牙髓会启动防御机制，一方面，成牙本质细胞会分泌更多的牙本质基质，形成修复性牙本质，以阻挡外界刺激的进一步深入，保护牙髓。另一方面，牙髓内的免疫细胞会被激活，引发炎症反应，试图清除刺激源。然而，如果刺激过于强烈或持续时间过长，牙髓的防御能力可能会被突破，导致牙髓炎症的发生。

反过来，牙髓的病变也会影响牙本质。当牙髓发生炎症时，牙髓内的压力升高，血液循环障碍，会影响成牙本质细胞的功能，导致牙本质的形成和矿化受到影响，牙本质的结构和性能可能会发生改变，如牙本质的硬度降低、通透性增加等。

综上所述，牙本质与牙髓相互依存、相互影响，在牙齿的正常生理功能和病理反应中都起着重要的作用。