在中药炮制过程中，清除种子类药物非药用部分是保证药效和用药安全的重要环节，以下是具体的操作方法：

首先是风选，这是利用药物与杂质的悬浮速度不同，借助风力将杂质除去。对于种子类药材，一些细小的尘土、瘪粒等杂质，因其质量轻，在风力作用下会与饱满的种子分离。操作时，可将种子置于簸箕等容器中，在通风处轻轻扬簸，使杂质随风飘走，饱满的种子则留在容器内。例如，在处理紫苏子等种子药材时，风选能有效去除其中夹杂的灰尘和干瘪的种子。

筛选也是常用的方法，依据药物和杂质的体积大小不同，选用不同孔径的筛网，使药物和杂质分离。对于种子类药材，可根据种子的大小选择合适的筛网。比如，处理芥子时，用合适孔径的筛网，能将大小不同的芥子进行筛选分级，同时除去混入的泥土、砂石等杂质。较大的杂质会留在筛网上面，而细小的杂质和符合要求的种子则通过筛网，从而达到分离的目的。

水选是利用药物与杂质的比重不同，经过水的漂浮或沉淀，将杂质除去。对于种子类药材，有些杂质如砂石等比重大，会沉淀在水底，而种子可能会漂浮在水面或悬浮在水中。以葶苈子为例，将其放入水中，杂质会下沉，而葶苈子会漂浮在水面，通过撇取的方式即可除去杂质。但在水选过程中，要注意控制时间和水温，避免种子因长时间浸泡而影响质量。

另外，还可以采用手工挑选的方法，对于一些体积较大、与种子容易区分的杂质，如树枝、草梗等，可通过手工直接将其挑出。这种方法虽然比较耗费人力，但能保证挑选的准确性，尤其适用于杂质较少的情况。例如，在处理使君子时，可手工挑出混入其中的果壳、树枝等杂质。

在清除种子非药用部分的操作过程中，要根据种子的特性、杂质的类型和含量等因素，选择合适的方法，并且严格遵循相关的炮制规范和标准，以确保处理后的种子符合药用要求。