拟胆碱药和拮抗药在药理学上有着明显的区别，主要体现在作用机制、药理效应、临床应用和不良反应等方面。

从作用机制来看，拟胆碱药是一类能与胆碱受体结合，激动受体，产生与乙酰胆碱类似作用的药物。它们可以直接作用于胆碱受体，如毛果芸香碱直接激动M胆碱受体；也可以通过抑制胆碱酯酶的活性，使乙酰胆碱在突触间隙的浓度升高，间接发挥拟胆碱作用，如新斯的明。而拮抗药则是能与受体结合，但不产生激动效应，反而妨碍乙酰胆碱或拟胆碱药与受体的结合，从而拮抗其作用的药物。比如阿托品能竞争性地阻断M胆碱受体，筒箭毒碱能阻断N2胆碱受体。

在药理效应方面，拟胆碱药激动M受体时，会产生一系列副交感神经兴奋的表现，如瞳孔缩小、心率减慢、胃肠道平滑肌收缩、腺体分泌增加等；激动N受体时，可引起骨骼肌收缩、神经节兴奋等。而拮抗药阻断M受体后，会出现与拟胆碱药相反的效应，如瞳孔散大、心率加快、胃肠道平滑肌松弛、腺体分泌减少等；阻断N2受体则会导致骨骼肌松弛。

临床应用上，拟胆碱药有着不同的用途。毛果芸香碱常用于治疗青光眼，通过缩小瞳孔，开放前房角，降低眼压；新斯的明可用于治疗重症肌无力，增加肌肉的收缩力。拮抗药的应用也十分广泛，阿托品可用于麻醉前给药，减少呼吸道腺体分泌，还可用于治疗有机磷中毒、缓解胃肠道绞痛等；筒箭毒碱是一种肌松药，在外科手术中可作为麻醉辅助用药，使肌肉松弛，便于手术操作。

不良反应方面，拟胆碱药使用过量时，会出现胆碱能危象，表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻、流涎、出汗、呼吸困难等，严重时可导致心脏骤停。拮抗药也有其不良反应，阿托品常见的不良反应有口干、视力模糊、心悸、皮肤潮红等，过量使用可导致中毒，出现高热、烦躁不安、幻觉、惊厥等症状。

综上所述，拟胆碱药和拮抗药在多个方面存在明显区别，了解这些区别对于合理用药、发挥药物的治疗作用以及避免不良反应至关重要。