药物分子中的一些特定基团可以显著影响其生物活性，这些基团通常被称为药效团。不同的基团具有不同的化学性质和物理特性，它们通过多种方式与生物体内的靶标（如受体、酶或核酸）相互作用，从而影响药物的效力、选择性和代谢过程。以下是几种常见的会影响药物生物活性的基团：
1. 疏水性基团：这类基团包括烷烃链、苯环等，它们能够增强分子与细胞膜脂质层之间的亲和力，有助于提高药物通过细胞膜的能力。
2. 氢键供体/受体：如羟基（-OH）、氨基（-NH2）等，这些基团可以形成氢键与其他分子或生物大分子上的相应部位结合，增强药物与靶点的结合力。
3. 电荷性基团：包括羧酸（-COOH）、胺（-NH2 ）等离子化基团。它们能改变药物分子的溶解度和pH值依赖的行为，对药物在体内的吸收、分布及排泄有着重要影响。
4. 共轭系统：如芳香环或烯烃等含有π电子云的结构，可以参与π-π堆积作用或是与靶标蛋白上的氨基酸残基发生静电相互作用。
5. 立体化学特性：手性中心的存在决定了分子的空间构型，不同的异构体可能具有截然不同的生物活性。例如，某些药物的一个对映体可能是有效的治疗剂，而另一个则没有效果甚至有毒副作用。
6. 金属配合物：一些含有过渡金属离子的化合物能够通过配位键与特定的生物大分子结合，表现出独特的药理作用。

综上所述，药物分子中的各种基团对其生物活性的影响是多方面且复杂的。在新药设计和开发过程中，通过对这些关键基团的研究和优化，可以有效提升药物的效果并减少不良反应。