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危险性评估在食品安全领域中应用的主要方面是制定食品安全标准（包括生产规范和指南）。无论是食品法典（CAC）标准或是国家标准的制定都必须基于危险性评估的结果。其次，危险性评估的应用还涉及进出口食品的监督检验，按照食品中危害的类别全面地分配各项食品安全管理工作的资源，评价食品安全政策、法规和标准出台后的效果等方面。另外，危害分析与关键控制点（HACCP）实施过程中体现着危险性分析的基本思路，可以称为危险性分析理论方法在现实卫生管理中的具体应用。因此，可以认为危险性评估的应用涉及食品安全的各方面，无论是科学研究，还是监督管理。我国食品安全法规定我国的食品安全风险评估由卫生部负责，并成立食品安全风险评估专家委员会开展评估。

（一）食品中化学物的危险评估化学物的危险性评估主要针对有意加入的化学物、无意污染物和天然存在的毒素，包括食品添加剂、农药残留及其他农业用化学品、兽药残留、不同来源的化学污染物以及天然毒素等。

（二）食品中的生物性因素的危险性评估生物性因素的危险性评估主要针对致病性细菌、霉菌、病毒、寄生虫、藻类及其毒素。生物性危害主要通过产生的毒素或宿主进食具有感染性的活病原体而影响人体健康。

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