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近日,我所张立华博士在《Disease Markers》杂志发表一篇名为“Identification of common genes refer to colorectal carcinogenesis with paired cancer and non-cancer samples” 的文章,周宏灏院士为文章通讯作者。
结直肠癌在全世界范围内发病率和死亡率均较高的恶性肿瘤。结直肠癌发生病因有很多,比如遗传因素、饮食因素、肠炎和息肉等。在分子水平,结直肠癌也是一种异质性很强的恶性肿瘤,直到目前,结直肠癌发生发展的分子机制仍旧不明确。
为了进一步探究人类结直肠癌发生发展的共性分子机制,本研究从公共数据库NCBI-GEO出发,下载并分析了3个配对的结直肠癌和非癌组织样本表达谱数据集(GSE21510,23对;GSE23878,17对样本;GSE32323,19对样本),以非癌组织为对照,分别对癌组织中表达上调和下调基因进行筛选。并将三个数据集的上调和下调差异显著基因取交集,得到181个共同上调基因和282个共同下调基因,对这些基因进行pathway和GO分析后,取MCM2,RNASEH2A,TOP2A共3个上调基因在16对结直肠癌和癌旁组织中进行荧光定量PCR实验,证实了三个基因在结直肠癌组织中高表达。以上研究为表达谱水平阐明结直肠癌发生发展的分子机制提供了依据。
原文链接:
https://www.hindawi.com/journals/dm/2018/3452739/