在医学微生物学中，对两菌属进行鉴定通常会采用多种方法，以下为你详细介绍：

形态学检查是重要的基础方法。可以通过光学显微镜观察细菌的大小、形态、排列方式等。例如，葡萄球菌属呈葡萄串状排列，而链球菌属常呈链状排列。同时，还可利用电子显微镜更清晰地观察细菌的超微结构，如细菌的细胞壁、细胞膜等，不同菌属的这些结构可能存在差异。

培养特性也是关键的鉴定依据。不同菌属对营养物质的需求不同，在不同的培养基上生长情况也有区别。比如，肠道杆菌属中的大肠杆菌能在普通营养琼脂培养基上良好生长，而结核分枝杆菌属则需要含有特殊营养成分的罗氏培养基才能生长。此外，观察细菌在培养基上的菌落特征，如大小、形状、颜色、表面光滑或粗糙、边缘整齐或不整齐等，也有助于菌属的初步判断。

生化反应是进一步鉴定菌属的常用方法。细菌具有不同的酶系统，能对不同的底物进行代谢，产生特定的代谢产物。通过检测这些代谢产物，可以区分不同的菌属。例如，利用糖发酵试验，观察细菌对不同糖类的发酵能力，大肠杆菌能发酵乳糖产酸产气，而伤寒沙门菌属则不发酵乳糖。另外，还可以进行吲哚试验、甲基红试验、VP试验、枸橼酸盐利用试验等，综合这些生化反应结果来准确鉴定菌属。

血清学鉴定是基于抗原 - 抗体反应的原理。每种菌属都有其特定的抗原结构，用已知的特异性抗体来检测未知细菌的抗原，从而确定菌属。例如，用沙门菌属的多价诊断血清与待检菌进行凝集试验，如果出现凝集现象，则提示待检菌可能属于沙门菌属。

分子生物学方法在现代菌属鉴定中越来越重要。通过检测细菌的核酸序列，如16S rRNA基因序列分析，不同菌属的16S rRNA基因序列具有一定的特异性，通过测序和比对，可以准确地鉴定菌属。此外，还可以采用PCR技术，针对特定菌属的基因片段进行扩增和检测，具有灵敏度高、特异性强的特点。

综上所述，在鉴定两菌属时，通常需要综合运用多种方法，从不同角度进行分析和判断，以确保鉴定结果的准确性。