土壤环境的自净作用即土壤环境的自然净化作用（或净化功能的作用过程），是指进入土壤的物质，通过稀释和扩散等作用可以降低其浓度，或者被转化为不溶性化合物而沉淀，或为胶体牢固地吸附，从而暂时脱离生物小循环及食物链；或者通过生物和化学的降解作用，转化为无毒或毒性小的物质，甚至成为营养物质；或经挥发和淋溶从土体中迁移至大气和水体，所有这些现象都可以理解为土壤的自净过程，但土壤的自净主要是指生物和化学的降解作用。

土壤的净化作用包括如下内容：

1.物理净化作用 土壤是一个多相的疏松多孔体，进入土壤中的难溶性固体污染物可被土壤机械阻留；可溶性污染物可被土壤水分稀释，降低毒性，或被土壤固相表面吸附，但可随水迁移至地表水或地下水层；某些污染物可挥发或转化成气态物质通过土壤孔隙迁移到大气介质中。

2.化学净化作用 污染物进入土壤后，可以发生一系列化学反应。如凝聚与沉淀反应、氧化还原反应、络合-螯合反应、酸碱中和反应、水解、分解化合反应，或者发生由太阳辐射能和紫外线等引起的光化学降解作用等。通过上述化学反应使污染物分解为无毒物质或营养物质。但对于性质稳定的化合物如多氯联苯、稠环芳烃医`学教育网整理、塑料和橡胶等难以被化学净化；重金属通过化学净化不能被降解，只能使其迁移方向发生改变。

3.生物净化作用 土壤中存在大量依靠有机物生存的微生物，它们具有氧化分解有机物的巨大能力，是土壤环境自净作用中最重要的净化途径之一。各种有机污染物在不同条件下分解的产物多种多样，并最终转化为对生物无毒的物质。

（1）病原体的死灭：病原体进入土壤后，受日光的照射，土壤中不适宜病原微生物生存的环境条件，微生物间的拮抗作用，噬菌体作用，以及植物根系分泌的杀菌素等许多不利因素的作用下而死亡。

（2）有机物的净化：土壤中的有机污染物在微生物的作用下，医学教育|网搜集整理使有机物逐步无机化或腐殖质化。

含氮有机物在土壤微生物的作用下，分解成氨或氨盐，称为氨化阶段。在氧气充足和亚硝酸菌的作用下，氨被氧化成亚硝酸盐，进一步在硝酸菌的作用下氧化成硝酸盐，称为硝化阶段。不含氮有机物也可在土壤微生物的作用下发生分解。含碳有机物在氧气充足的条件下最终形成二氧化碳和水，在厌氧条件下则产生甲烷。含硫和磷的有机物，在氧气充足的条件下最终分别形成硫酸盐或磷酸盐。在厌氧条件下则产生硫醇医`学教育网整理、硫化氢或磷化氢的等恶臭物质，与含氮、碳有机物产生的氨、甲烷等一起以恶臭污染环境。

有机物在土壤微生物的参与下不断分解又不断合成，最后变成腐殖质（humus）的过程称为有机物的腐殖化。腐殖质的成分很复杂，其中含有木质素、蛋白质、碳水化合物、脂肪和腐殖酸等。腐殖质的化学性质稳定，病原体已经死灭，不招引苍蝇，无不良气味，质地疏松，在卫生上是安全的，又是农业上良好的肥料。常用的人工堆肥法就是使大量有机污染物在短时间内转化为腐殖质而达到无害化的目的。

土壤中的污染物被生长的植物所吸收、降解，并随茎叶、种子离开土壤；或被土壤中的蚯蚓等软体动物所食用等也属于土壤环境生物净化作用。