南五味子和五味子在植物学上属于同一种属，即五味子科五味子属。不过，在传统中医中，它们有一些细微的区别：
1. 来源不同：
   - 五味子（Schisandra chinensis）：主要产于中国东北、华北等地。
   - 南五味子（Schisandra sphenanthera）：主要分布在中国南方地区，如四川、湖北等。
2. 外观特征：
   - 五味子果实较小，呈红色或紫红色，表面光滑有光泽。
   - 南五味子果实较大，颜色较深，通常为暗紫色，表面略显粗糙。
3. 化学成分：
   - 五味子主要含有木脂素类化合物（如五味子醇、五味子乙素等），这些成分具有抗氧化、抗疲劳和保肝作用。
   - 南五味子也含有类似的木脂素类化合物，但具体种类和含量可能有所不同。
4. 药理作用：
   - 五味子在传统中医中主要用于敛肺止咳、涩精止泻、宁心安神等。它对肝脏有保护作用，可以用于治疗慢性肝炎。
   - 南五味子的作用与五味子相似，但可能在某些方面略有差异。例如，南五味子在临床上有时被用于治疗肾虚引起的腰膝酸软等症状。

5. 使用注意：
   - 五味子和南五味子虽然药效类似，但在具体应用时仍需根据患者的实际情况选择合适的药材。
   - 孕妇、哺乳期妇女以及有特殊疾病的人群在使用前应咨询医生或药师的意见。

总的来说，南五味子和五味子在植物学上是同属不同种的植物，在传统中医中有一些细微的区别。了解这些区别有助于更准确地选择和应用这两种药材。