小儿腹泻病是一组由多病原、多因素引起的以大便次数增多和大便性状改变为特点的消化道综合征，常见病因主要分为感染性和非感染性两类。

感染性因素方面，病毒感染是较为常见的原因，其中轮状病毒是引起秋冬季小儿腹泻的主要病原，其他还包括诺如病毒、肠道腺病毒等。细菌感染也不容忽视，大肠杆菌是常见病原菌，如致病性大肠杆菌、产毒性大肠杆菌等，此外，空肠弯曲菌、耶尔森菌等也可导致小儿腹泻。寄生虫感染如蓝氏贾第鞭毛虫、阿米巴原虫等也能引起肠道炎症，造成腹泻。真菌中白色念珠菌感染在小儿腹泻中也偶有发生，多在机体抵抗力下降或长期使用抗生素后出现。

非感染性因素主要有饮食因素。喂养不当是常见情况，比如喂养不定时、过多过少、突然改变食物品种等，都可能导致小儿消化功能紊乱而引起腹泻。过敏性腹泻则是小儿对牛奶、大豆等食物过敏，进食相应食物后引发肠道过敏反应，出现腹泻症状。气候因素也会影响，天气突然变冷，腹部受凉使肠蠕动增加；天气过热，消化液分泌减少，且由于口渴又吃奶过多，增加消化道负担，均易诱发腹泻。此外，小儿消化系统发育尚未成熟，胃酸和消化酶分泌较少，消化酶的活性较低，对食物的耐受力差，不能适应食物质和量的较大变化，也是容易发生腹泻的内在因素。同时，小儿机体防御功能较差，胃酸偏低，胃肠排空较快，对进入胃肠道的细菌杀灭能力较弱，血清免疫球蛋白和胃肠道分泌型IgA较低，容易感染导致腹泻。