诊断原发性肝癌的指标有多种，这些指标相互配合，有助于准确诊断原发性肝癌。

血清肿瘤标志物方面，甲胎蛋白（AFP）是诊断原发性肝癌的重要指标。AFP是一种糖蛋白，正常情况下主要由胎儿肝细胞及卵黄囊合成，出生后其合成很快受到抑制。当肝细胞发生癌变时，又恢复了产生这种蛋白质的功能，导致血液中AFP水平升高。在排除妊娠、生殖腺胚胎瘤等情况后，血清AFP≥400μg/L持续4周，或AFP在200μg/L以上的中等水平持续8周，结合影像学检查发现肝脏占位性病变，就高度提示原发性肝癌。

异常凝血酶原（PIVKA - II）也是重要指标。肝癌细胞具有合成和释放异常凝血酶原的功能，在肝癌患者中，PIVKA - II常显著升高，且其诊断的特异性较高，尤其对于AFP阴性的肝癌患者，PIVKA - II的检测有重要的补充诊断价值。

影像学检查指标也很关键。超声检查可以清晰显示肝脏的形态、大小以及有无占位性病变，能发现直径1cm左右的微小肝癌，还可观察肿瘤的血供情况。CT检查能更准确地显示肝脏的解剖结构和肿瘤的大小、位置、数目及与周围组织的关系，增强CT扫描可以更好地显示肿瘤的血供特点，有助于肝癌的定性诊断。磁共振成像（MRI）对软组织的分辨能力较强，能够多方位、多序列成像，对于肝癌的诊断和鉴别诊断具有重要意义，特别是对一些小肝癌的检出率较高。

肝穿刺活检是诊断原发性肝癌的金标准。在超声或CT引导下，用细针经皮穿刺肝脏占位性病变，获取组织进行病理学检查，能够明确肿瘤的性质、细胞类型等，为后续的治疗提供重要依据。但这是一种有创检查，存在一定的风险，需要严格掌握适应证。

综上所述，诊断原发性肝癌需要综合血清肿瘤标志物、影像学检查以及必要时的肝穿刺活检等多方面的指标，以提高诊断的准确性。