在初级中药师工作中，分离根茎类药材的非药用部位是保证药材质量和药效的重要环节，以下是一些常见的方法。

首先是挑选与筛选。将采收回来的根茎类药材平铺在干净的工作台上，通过人工挑选的方式，把明显的杂质、变质部分以及非药用的须根、外皮等去除。比如人参，要去除芦头、支根上的细小须根等非药用部位。对于一些夹杂在药材中的泥土、沙石等杂质，可以通过筛选的方式，利用不同孔径的筛网，让细小的杂质通过筛网落下，从而达到初步分离的目的。

其次是清洗与浸泡。把挑选后的根茎药材放入清水中，通过搅拌、冲洗等操作，进一步去除表面的泥土和附着的杂质。对于一些外皮较厚且非药用的根茎，如地黄，可将其浸泡在水中一段时间，使外皮软化，便于后续去除。浸泡时间要根据药材的性质来确定，避免浸泡时间过长导致有效成分流失。

再者是去皮与修剪。对于需要去除外皮的根茎类药材，可以使用刀具进行去皮操作。比如牡丹皮，用刀将其外皮刮去。对于形状不规则的根茎，还需要进行修剪，去除多余的分支和非药用的部分，使药材符合药用标准。

另外，还可以采用机械分离的方法。对于大量的根茎类药材，可以使用专门的机械设备进行分离。如筛选机、去皮机等，提高工作效率。但在使用机械设备时，要注意调整设备参数，避免对药用部位造成损伤。

最后，分离后的药材要进行质量检查，确保非药用部位完全去除，药用部位符合质量要求。同时，要对分离过程中产生的废弃物进行妥善处理，避免对环境造成污染。通过以上一系列的方法，可以有效地分离根茎类药材的非药用部位，保证药材的质量和药效。