影响免疫功能的药物主要分为免疫抑制剂和免疫增强剂，它们在发挥治疗作用的同时，也可能带来一些不良反应。

免疫抑制剂的不良反应较为常见且多样。长期使用糖皮质激素类免疫抑制剂，可能导致类肾上腺皮质功能亢进综合征，出现满月脸、水牛背、向心性肥胖、皮肤变薄、多毛、水肿、低血钾、高血压、糖尿病等症状。还可能诱发或加重感染，因为其抑制了机体的免疫防御功能，使机体对病原体的抵抗力下降。此外，它会影响伤口愈合，导致骨质疏松，增加股骨头坏死的风险，也可能引起精神神经症状，如欣快、激动、失眠等。

环孢素主要的不良反应是肾毒性，可导致血清肌酐和尿素氮水平升高，影响肾功能。还可能出现肝毒性，引起肝功能损害。另外，有多毛、牙龈增生、胃肠道不适等症状，也会增加感染和肿瘤的发生风险。

硫唑嘌呤等抗代谢类免疫抑制剂，可能导致骨髓抑制，使白细胞、血小板减少，进而引起感染和出血倾向。还可能有胃肠道反应，如恶心、呕吐、腹泻等，长期使用也有致癌的潜在风险。

免疫增强剂也并非完全安全。胸腺肽可能引起过敏反应，如皮疹、瘙痒、呼吸困难等，严重时可导致过敏性休克。干扰素可能会有类似流感样症状，如发热、寒战、乏力、肌肉酸痛等，还可能影响血液系统，导致白细胞和血小板减少，也会对神经系统产生影响，出现抑郁、焦虑等精神症状。

总之，影响免疫功能的药物在使用过程中需要密切关注不良反应，权衡利弊，并根据患者的具体情况进行合理调整和监测。