影响包合制备的因素主要涉及主客分子的结构和性质、包合作用的条件以及制备方法等多个方面。

从主客分子的结构和性质来看，主分子方面，包合材料的种类和性质起着关键作用。例如，常用的包合材料环糊精，不同类型的环糊精（如α - 环糊精、β - 环糊精、γ - 环糊精）其分子结构和空腔大小不同，对客体分子的包合能力和选择性也不同。β - 环糊精是最常用的，但其水溶性相对较差，会影响包合效果。若对其进行化学修饰，如制成羟丙基 - β - 环糊精，可改善水溶性，从而提高包合效率。客体分子的性质同样重要，客体分子的大小、形状、极性等会影响其能否进入主分子的空腔以及包合的稳定性。一般来说，客体分子的大小应与主分子的空腔相匹配，极性较强的客体分子更容易与具有一定极性的主分子形成稳定的包合物。

包合作用的条件也会产生显著影响。温度是一个重要因素，温度过高可能破坏主客分子间的相互作用力，使包合物不稳定；温度过低则可能导致包合反应速率过慢。pH值会影响主客分子的解离状态，进而影响它们之间的相互作用。例如，某些药物在不同pH值下的存在形式不同，可能会影响其与包合材料的包合效果。此外，搅拌时间和强度也很关键。适当的搅拌可以增加主客分子的碰撞机会，促进包合反应的进行，但搅拌时间过长或强度过大可能会破坏已形成的包合物。

制备方法对包合也有很大影响。常见的制备方法有饱和水溶液法、研磨法、超声法等。不同的制备方法其操作条件和原理不同，会导致包合物的产率、包合率和稳定性有所差异。例如，饱和水溶液法是将包合材料制成饱和溶液，再加入客体分子进行包合，该方法操作相对简单，但包合时间较长；超声法利用超声波的空化效应加速包合反应，可缩短制备时间，但可能需要特殊的设备。

综上所述，在包合制备过程中，需要综合考虑主客分子的结构和性质、包合作用的条件以及制备方法等因素，