巨幼红细胞贫血主要缺乏维生素B12和（或）叶酸。

维生素B12是一种水溶性维生素，在体内参与多种重要的生理过程。它参与细胞的核酸代谢，特别是DNA的合成。维生素B12缺乏时，会导致DNA合成障碍。因为DNA是细胞分裂和增殖的关键物质，DNA合成受阻会使细胞分裂延迟，而RNA的合成相对正常，导致细胞核和细胞质发育不平衡，细胞体积增大，形成巨幼样变的红细胞。维生素B12还参与神经系统的代谢，缺乏它可能会引起神经系统症状，如手足麻木、感觉异常、行走不稳等。维生素B12的吸收需要内因子的参与，内因子由胃黏膜的壁细胞分泌。如果因胃黏膜萎缩、内因子缺乏、肠道吸收不良等原因，都可能导致维生素B12摄入不足或吸收障碍。

叶酸也是参与DNA合成的重要物质。叶酸在体内经过一系列代谢转化后，为DNA合成提供一碳单位。当叶酸缺乏时，同样会影响DNA的合成，使细胞分裂受阻，导致红细胞呈现巨幼样改变。叶酸主要来源于新鲜的蔬菜和水果等食物，如果长期饮食中缺乏新鲜蔬果，或者因某些疾病导致肠道吸收不良，以及长期服用某些影响叶酸代谢的药物等，都可能引起叶酸缺乏。

综上所述，巨幼红细胞贫血主要是由于维生素B12和（或）叶酸缺乏，影响了红细胞的正常生成和发育，从而导致贫血的发生。在临床诊断和治疗中，需要明确是缺乏维生素B12还是叶酸，或者两者都缺乏，以便采取针对性的补充治疗措施。