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染源是患者和带菌者，其中带菌者和仅有上呼吸道变的患者是本病的主要传染源。典型患者在潜伏期至病后10d内有传染性，但发病后被迫卧床，与人群接触机会少，故作为传染源的重要性相应减少。但又由于患者呼吸道排出的病原菌多为流行菌株，所以仍有隔离的必要。
流行期间人群鼻部带菌率显著增高，带菌人数为患者的10～20倍，一般带菌规律是流行季节高于非流行季节，流行区高于非流行区，流行年高于非流行年，但某些地区带苗率高达70%以上而并未发现患者，相反，有的地区带菌率仅在10%左右就出现了患者，流脑的流行主要与人群中该群脑膜炎球菌的人相应抗体水平有关
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