超抗原和普通抗原的主要区别在于它们刺激免疫系统的机制不同。下面详细解释这两者的差异及其作用机制：

首先，普通抗原是指那些需要被抗原呈递细胞（如巨噬细胞或树突状细胞）处理后，才能与主要组织相容性复合体（MHC）分子结合，并最终激活T细胞的物质。这个过程涉及抗原的摄取、加工和呈递等步骤，是一个相对复杂的过程。普通抗原能够特异性地识别并结合到特定的TCR上，从而引发免疫反应。

而超抗原则是一种特殊的蛋白质或肽链，它们不需要经过上述复杂的处理过程就能直接与MHC分子及T细胞受体（TCR）同时结合，导致大量T细胞被激活。这种非特异性的激活方式使得超抗原能够引起异常强烈的免疫应答，有时会导致严重的病理反应。

具体来说，在作用机制方面：
1. 普通抗原：首先由APC摄取并加工成小片段；然后这些片段与MHC分子结合形成复合物；最后该复合物被展示在细胞表面，等待特定的T细胞识别。只有当某个T细胞上的TCR与这个MHC-抗原复合物匹配时，才能激活相应的免疫反应。
2. 超抗原：可以直接与APC表面上的MHC II类分子以及多种不同类型的T细胞受体结合。这种结合不依赖于特定序列的识别，而是基于超抗原与MHC和TCR之间的广泛亲和力。因此，即使是很低浓度的超抗原也能迅速激活大量T细胞，导致炎症介质的释放和其他免疫效应。

总之，虽然两者都能引发免疫反应，但超抗原因其独特的结合方式而具有更强、更广泛的刺激效果。在临床实践中，了解这些差异对于诊断某些疾病（如食物中毒或毒力较强的细菌感染）以及开发新的疫苗策略都至关重要。