由于你没有明确指出“该病”具体是什么疾病，在运动系统中，有多种疾病在早期存在不同的主要致病菌。下面为你列举运动系统常见疾病早期的主要致病菌。

首先是急性血源性骨髓炎，这是运动系统较为常见的感染性疾病。在早期，其主要致病菌是金黄色葡萄球菌，这种细菌致病力强，能够产生多种毒素和酶，破坏骨组织。金黄色葡萄球菌可通过血液循环到达骨组织，在长骨干骺端生长繁殖，引发炎症反应。它还可以释放一些物质，导致骨质破坏、局部脓肿形成。除此之外，乙型溶血性链球菌也是急性血源性骨髓炎早期可能的致病菌之一，它能产生溶血素和多种酶类，侵袭周围组织，引起炎症扩散。

其次是化脓性关节炎，早期的主要致病菌同样以金黄色葡萄球菌最为常见。金黄色葡萄球菌可经身体其他部位的感染灶，如皮肤疖肿、呼吸道感染等，通过血行传播至关节腔。一旦进入关节，它会迅速繁殖，破坏关节软骨和滑膜组织。另外，白色葡萄球菌、淋病奈瑟菌等也可能成为化脓性关节炎早期的致病菌。淋病奈瑟菌主要通过性传播，侵犯关节，多见于青年男性，可引起急性化脓性关节炎，导致关节疼痛、肿胀、活动受限等症状。

再者是骨髓炎中的慢性骨髓炎，早期可能是急性骨髓炎治疗不彻底迁延而来，致病菌与急性骨髓炎类似，金黄色葡萄球菌依然是主要致病菌。此外，大肠杆菌等革兰氏阴性杆菌也较为常见。这些细菌在骨组织内长期存在，形成慢性炎症，不断破坏骨质，导致骨质增生、死骨形成等病理改变。

总之，运动系统不同疾病早期的主要致病菌有所不同，但金黄色葡萄球菌在多种感染性疾病中都较为常见。准确判断致病菌对于疾病的诊断和治疗至关重要，临床上通常需要通过细菌培养等检查手段来明确致病菌，从而选择敏感的抗生素进行治疗。