蛋白质能量营养不良是一种因缺乏能量和（或）蛋白质引起的营养缺乏症，以下是其常见病因。

一、摄入不足
这是导致蛋白质能量营养不良的重要原因。在婴幼儿时期，如果喂养不当，比如母乳不足又未及时添加合适的辅食，或者人工喂养时奶粉配制过稀；较大儿童若有不良饮食习惯，如偏食、挑食、吃过多零食等，会使蛋白质和能量的摄入不能满足生长发育的需求。在贫困地区，食物供应不足，尤其是缺乏富含蛋白质的食物，也是造成摄入不足的重要因素。

二、消化吸收不良
消化系统疾病会影响食物的消化和吸收。例如唇裂、腭裂等先天畸形，会影响进食；迁延性腹泻、过敏性肠炎、肠吸收不良综合征等肠道疾病，会使食物不能充分消化吸收，导致营养物质丢失过多。此外，慢性肝炎、肝硬化等肝脏疾病会影响蛋白质的合成与代谢，胰腺疾病会影响消化酶的分泌，进而影响食物的消化，最终造成蛋白质和能量的缺乏。

三、需要量增加
在一些特殊生理或病理情况下，机体对蛋白质和能量的需要量会增加。生长发育迅速的婴幼儿、青春期少年，对营养的需求相对较高，如果供给不足，容易发生营养不良。患有发热性疾病、感染性疾病（如肺炎、结核病等）、恶性肿瘤等，机体代谢加快，消耗增多，若没有及时补充足够的营养，也会导致蛋白质能量营养不良。

四、其他因素
早产、多胎等出生时低体重儿，其体内储存的营养物质相对较少，出生后生长发育快，更容易出现蛋白质能量营养不良。另外，心理因素如长期精神紧张、焦虑等，也可能影响食欲，导致摄入减少，增加营养不良的发生风险。

综上所述，蛋白质能量营养不良的病因是多方面的，了解这些病因有助于采取针对性的预防和治疗措施。