自体瓣膜亚急性感染性心内膜炎（IE）是一种严重的感染性疾病，其病因主要涉及病原微生物和心脏基础病变两方面。

病原微生物方面，草绿色链球菌是最为常见的致病菌，约占自体瓣膜亚急性IE病因的65%。草绿色链球菌通常寄居于口腔、上呼吸道，在进行拔牙、扁桃体摘除等口腔手术或上呼吸道手术操作时，细菌可从感染灶侵入血流，引发菌血症。由于该菌的毒力相对较弱，细菌入血后可在心脏瓣膜表面黏附、繁殖，进而导致感染性心内膜炎。此外，葡萄球菌也是常见致病菌之一，占比约为25%，其中以金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌较为多见。葡萄球菌可通过皮肤、软组织感染等途径进入血液循环，进而侵犯心脏瓣膜。肠球菌约占5% - 10%，多来源于泌尿生殖道或胃肠道感染，在进行相关检查或手术操作时可进入血流引发感染。

心脏基础病变方面，约80%的自体瓣膜亚急性IE患者存在心脏基础疾病。风湿性心瓣膜病是最常见的基础病变，尤其是二尖瓣和主动脉瓣关闭不全。瓣膜的病变使得血流动力学发生改变，导致瓣膜表面压力下降、内膜受损，血小板和纤维蛋白易于沉积，形成无菌性赘生物。此时，当有菌血症发生时，细菌就容易在赘生物上黏附、繁殖，从而引发感染性心内膜炎。先天性心脏病如室间隔缺损、动脉导管未闭等也会导致心脏内血流异常，增加细菌感染的风险。此外，退行性心脏瓣膜病、二尖瓣脱垂等也可能成为自体瓣膜亚急性IE的发病基础。

另外，患者自身的免疫状态也与发病相关。如长期使用免疫抑制剂、患有恶性肿瘤、艾滋病等导致机体免疫力低下的情况，会增加感染的易感性，使得病原微生物更容易在心脏瓣膜定植并引发感染。