湖南省药学会成立于1954年5月，第一届理事长为著名药理学家叶雨文教授。目前为第十三届，现任理事长为著名遗传药理学家、中国工程院院士周宏灏教授。

1954年至1990年为中国药学会湖南分会，1990年10月由湖南省民政局核准登记为社团法人，更名为湖南省药学会。经过近60余年的发展，湖南省药学会已由当时会员数十人，发展到现有个人会员7000余人，团体会员10个。

1987年，我国著名医院药学专家许树梧教授出任第八届理事长，此期间由于药学事业的快速发展，药学人员对学术研究及学术活动的要求日益强烈，为了适应此种要求，湖南省药学会先后成立了医院药学、药物分析、中药天然药物、制药工程、药理学、药事管理等六个专业委员会医学教育网编辑整|理。

2002年，我国著名遗传药理学专家周宏灏院士出任第十一届理事长，特别是2008年、周宏灏院士连任第十二届理事长期间，带领学会建章立制、开拓工作、交流学术、培养人才，学会工作逐步规范化。此期间举办了各种学术活动，特别是承办了在长沙召开的“2009年中国药学大会暨第九届中国药师周”，受到中国药学会好评。2011年在周院士倡导下成立了湖南省药学会药物基因组学专业委员会。

2012年10月，湖南省药学会召开了第十三届会员代表大会，选举产生了第十三届理事会，周宏灏院士再次当选理事长。