奶类食品的卫生问题是多方面的，主要包括以下几个方面。

微生物污染是奶类食品常见的卫生问题之一。在奶牛的饲养过程中，如果牛舍卫生条件差、挤奶器具消毒不彻底等，都可能使牛奶受到细菌、真菌等微生物的污染。例如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等，这些微生物在适宜的温度下会迅速繁殖，不仅会导致牛奶变质，产生异味、沉淀等现象，还可能引起食用者的胃肠道不适，出现腹痛、腹泻、呕吐等症状。而且有些微生物还会产生毒素，如金黄色葡萄球菌产生的肠毒素，即使经过加热处理，毒素也不一定能完全被破坏，对人体健康构成严重威胁。

化学性污染也不容忽视。农药兽药残留是其中一大问题，奶牛在养殖过程中可能会接触到各种农药，如用于牛舍防虫的杀虫剂，以及治疗奶牛疾病使用的抗生素、激素等兽药。若这些药物使用不当或在牛奶中的残留量超标，长期摄入含有这些残留物质的奶类食品，可能会影响人体的正常生理功能，如抗生素残留可能导致人体菌群失调、产生耐药性等。此外，环境中的重金属污染，如铅、汞、镉等，也可能通过奶牛摄入受污染的饲料、饮水等途径进入牛奶中，长期积累会损害人体的神经系统、肾脏等重要器官。

另外，奶类食品在加工、储存和运输过程中也存在卫生隐患。加工过程中，如果车间环境不卫生、操作人员不遵守卫生规范，可能会再次引入微生物污染。储存条件不当，如温度过高，会加速微生物的生长繁殖。运输过程中，如果没有采取合适的保鲜措施，也容易导致奶类食品变质。而且，一些不良商家为了延长奶类食品的保质期、改善口感等，可能会违规添加防腐剂、增稠剂等食品添加剂，这些添加剂的过量使用也会对人体健康造成危害。总之，保障奶类食品卫生需要从奶牛养殖、加工、储存、运输等多个环节严格把控。