通过显微结构来识别不同的根和根茎类中药材是一种重要的鉴定方法，能够有效地区分相似药材或防止掺假。以下是几种主要的显微鉴别特征：
1. 细胞壁加厚情况：不同种类的植物其细胞壁加厚的程度、方式以及分布都有所区别。例如，某些药用植物如黄连、白术等，它们的石细胞特别发达且分布广泛；而另一些则可能在皮层或髓部出现特殊的厚壁组织。
2. 草酸钙晶体：许多根和根茎类药材含有草酸钙结晶，包括簇晶、方晶、针晶等形式。比如大黄中的草酸钙簇晶非常典型，可以作为其重要鉴别依据之一。
3. 导管类型与排列：导管是植物体内水分运输的重要通道，在显微镜下观察到的导管形态（如孔纹导管、网纹导管等）及其在组织中分布规律也是重要的鉴别点。例如，川芎具有明显的梯状穿孔板。
4. 淀粉粒特征：部分药材含有丰富的淀粉粒，其形状、大小以及脐点和层纹的有无都是很好的区分依据。如甘草中的椭圆形或类圆形淀粉粒就很有特点。
5. 皮层结构与维管束排列：观察根及根茎的横切面时，皮层厚度及其内部是否含有分泌组织（如油室、乳汁管等），以及木质部和韧皮部之间的关系都可作为鉴别依据。例如，当归的皮层较宽，并有众多的油室散在。
6. 纤维与纤维束：一些药材中存在特殊的纤维或纤维束结构，它们的形态特征（如长度、宽度、颜色等）对药材的识别具有重要意义。如人参根中的韧皮纤维呈长梭形，边缘不规则。

通过综合以上多个方面的显微特征，并结合其他鉴定手段（如化学成分分析），可以较为准确地鉴别出不同种类的根及根茎类中药材。在实际操作中，通常需要借助光学显微镜进行详细的观察和测量工作。