在中药鉴定中，显微鉴别是一项重要的技术手段。通过对药材的组织构造和细胞特征进行观察分析，可以有效地辨别不同的根及根茎类中药材。以下是几种常见的通过显微结构来区分不同种类的方法：
1. 观察表皮层：一些植物的表皮细胞形态、大小以及排列方式具有特异性，例如有些药材表面有明显的气孔或毛状物等。
2. 识别皮层构造：皮层是根和根茎的主要部分之一，其结构变化多样。如某些药材含有大量的纤维束或者石细胞群；而另一些则可能呈现特殊的分泌腔、油室等特点。
3. 分析维管柱特征：维管柱包括木质部、韧皮部等重要组成部分。不同种类的中药材在这些区域可能会表现出不同的颜色反应、导管类型（如螺纹导管、网纹导管）、纤维分布情况等等。
4. 检查髓部特点：部分药材的髓部具有显著特征，比如含有大量淀粉粒或其他特殊物质。
5. 特殊成分的存在与否及其位置：有些中药材中存在特定化学成分，并且这些成分往往会在细胞内的固定位置积累。例如丹参中的丹酚酸B主要存在于皮层和韧皮部；而黄连的生物碱则多见于髓部。
6. 细胞壁加厚情况及形状：如石细胞、纤维等细胞类型，其细胞壁厚度、形状各异，可以作为区分依据之一。
7. 淀粉粒形态与分布：许多根和根茎类药材含有丰富的淀粉质，在显微镜下观察到的淀粉粒大小、形状及其在组织中的分布情况也是重要的鉴别特征。
8. 草酸钙结晶类型及分布：草酸钙结晶是很多中药材中常见的内含物，其形态多样（如针晶、方晶等），并且在细胞内的位置也具有一定的规律性，可以作为辅助鉴定的依据之一。

通过上述方法结合实际情况进行综合分析，通常能够准确地鉴别出不同的根和根茎类中药材。当然，在实际操作过程中还需要积累丰富的经验，并辅以其他检验手段如化学定性、定量分析等来提高鉴别的准确性。