水飞法处理朱砂具有多方面的重要作用，主要体现在以下几个方面。

首先，在纯净药物方面，朱砂中常夹杂有泥土、砂石等杂质，通过水飞法可以将这些杂质去除，使朱砂更加纯净。因为水飞时，朱砂与水混合研磨，杂质会悬浮于水面或沉淀在水底，而纯净的朱砂细粉则均匀分散在水中，经过多次的研磨、倾取、沉淀等操作，就能有效地分离出纯净的朱砂，保证了药物的质量和纯度。

其次，降低毒性也是水飞法处理朱砂的关键作用之一。朱砂的主要成分是硫化汞，但可能含有微量的游离汞及其他有毒物质。水飞过程中，这些有毒物质会溶解于水中而被除去，从而降低了朱砂的毒性。同时，水飞法还能使朱砂的颗粒变得细小均匀，减少了人体对汞的吸收量，进一步降低了潜在的毒性危害，提高了用药的安全性。

再者，水飞法有助于朱砂制剂的制备。经过水飞处理后，朱砂的粉末更加细腻，粒度均匀，在制备丸剂、散剂等剂型时，能够更好地与其他药物混合均匀，保证了制剂的质量和药效的稳定性。细腻的朱砂粉末还能使制剂的外观更加光滑、均匀，提高了制剂的美观度和质量。

最后，水飞法可以改善朱砂的药理作用。细小的朱砂颗粒具有更大的比表面积，与生物膜的接触面积增加，从而更有利于药物的吸收和发挥作用，能够更好地发挥朱砂清心镇惊、安神解毒的功效，提高了药物的临床疗效。

综上所述，水飞法处理朱砂在纯净药物、降低毒性、利于制剂制备以及改善药理作用等方面都具有重要意义，是一种科学且有效的炮制方法。