菌类中药的入药部位主要是真菌的子实体、菌核或菌丝体等，以下为你详细介绍。

子实体是很多菌类中药的常见入药部位。子实体是高等真菌在繁殖阶段形成的具有一定形态和结构、能产生孢子的菌丝体结构。比如灵芝，其入药部位就是干燥子实体。灵芝的子实体形态独特，菌盖通常呈半圆形或近圆形，表面有光泽和环状棱纹等特征。它具有补气安神、止咳平喘等功效，在临床上应用广泛，可用于治疗心神不宁、失眠心悸、肺虚咳喘等病症。还有马勃，也是以子实体入药，马勃子实体幼时内部肉质，成熟后则变为粉末状，具有清肺利咽、止血的作用，常用于治疗风热郁肺咽痛、音哑、咳嗽等。

菌核也是菌类中药重要的入药部位。菌核是真菌在生长发育过程中，由菌丝体紧密聚集而成的一种坚硬的、具有贮藏功能的休眠体。例如茯苓，它是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。茯苓菌核呈类球形、椭圆形、扁圆形或不规则团块，外皮薄而粗糙，棕褐色至黑褐色。茯苓具有利水渗湿、健脾、宁心的功效，可用于水肿尿少、痰饮眩悸、脾虚食少、便溏泄泻、心神不安、惊悸失眠等。猪苓同样是以菌核入药，猪苓菌核呈不规则块状或条形，表面黑色、灰黑色或棕黑色，它有利水渗湿的作用，常用于小便不利、水肿、泄泻、淋浊、带下等病症。

此外，还有一些菌类中药以菌丝体入药。比如雷丸，它是白蘑科真菌雷丸的干燥菌核，其主要成分就是菌丝体。雷丸具有杀虫消积的功效，可用于绦虫、钩虫、蛔虫病，虫积腹痛，小儿疳积等。

综上所述，菌类中药的入药部位因品种而异，不同的入药部位也决定了它们具有不同的药用价值和临床应用。