脑栓塞主要是由于血流中的栓子（如血栓、脂肪滴、空气泡或肿瘤细胞等）随血液流动，最终堵塞了脑部血管所引起的。其中最常见的原因是心源性因素，比如心脏瓣膜病、心房颤动、心肌梗死或者心脏手术后形成的心内血栓脱落，这些血栓随着血液循环进入大脑，阻塞脑内的小动脉或中等大小的动脉，导致相应供血区域的脑组织缺血甚至坏死。此外，非心源性的因素如动脉硬化斑块破裂、感染性栓子、脂肪栓塞等也能引起脑栓塞。
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