中西医结合在伦理上面临的挑战是多方面的，主要可以从以下几个角度来探讨：

首先，在理论体系和价值观方面，中医与西医有着不同的哲学基础。中医强调的是整体观念和辨证施治，而西医则更注重于病因学、病理学的研究以及实验证据的支持。这种差异可能导致医生在临床决策时面临选择难题，尤其是在治疗方案的选择上如何平衡两种医学体系的原则。

其次，在医疗实践过程中，中西医结合可能会导致患者知情同意权的问题。由于中医和西医对于疾病的认知不同，因此在向患者解释病情、治疗目的及可能产生的风险时可能存在沟通障碍，这要求医生能够准确地将两种医学知识转化为易于理解的语言，并确保患者充分了解所有相关信息后做出自主选择。

再者，中西医结合还涉及到药物相互作用的伦理考量。当同时使用中药和西药进行治疗时，可能会出现未知或未预见的药物间相互作用，这对患者的健康安全构成了潜在威胁。因此，在这种情况下，医生需要谨慎评估每种治疗方法的安全性和有效性，并尽量避免不必要的风险。

最后，中西医结合还面临资源分配不均等伦理问题。在中国，由于地理、经济条件等因素的影响，不同地区之间的中医药服务可及性存在较大差异。如何合理配置有限的医疗资源，确保所有患者都能公平地享受到高质量的中西医结合医疗服务，也是需要关注的一个重要方面。

综上所述，中西医结合在伦理上面临诸多挑战，但通过不断加强跨学科交流与合作、提高医生的专业素养以及完善相关法律法规等措施，可以逐步解决这些问题。