藏象学说中的脏腑可分为五脏、六腑和奇恒之腑三类。

五脏包括心、肝、脾、肺、肾。心被称为“君主之官”，主血脉，推动血液在脉管中运行，向全身输送营养物质；同时心主神明，主宰人体的精神、意识和思维活动。肝主疏泄，能够调节气机的通畅，促进血液和津液的运行，还能调节情志；肝又主藏血，有贮藏血液和调节血量的功能。脾主运化，将饮食水谷转化为水谷精微，并将其吸收、转输到全身；脾还主统血，能统摄血液在脉管内运行而不逸出脉外。肺主气司呼吸，是体内外气体交换的场所；肺又主宣发和肃降，能将清气布散到全身，同时将代谢后的浊液下输到肾和膀胱；此外，肺还有通调水道的作用，调节水液的输布和排泄。肾藏精，主管人体的生长、发育与生殖；肾主水，主持和调节人体水液代谢；肾主纳气，有助于肺保持呼吸的深度。

六腑有胆、胃、小肠、大肠、膀胱、三焦。胆贮存和排泄胆汁，帮助消化食物，并且具有决断的功能。胃主受纳和腐熟水谷，是人体消化食物的重要场所。小肠主受盛化物和泌别清浊，进一步消化食物，并将清者吸收，浊者下传大肠。大肠主传化糟粕，将小肠传来的食物残渣形成粪便排出体外。膀胱主要功能是贮存和排泄尿液。三焦是人体上、中、下三焦的合称，有通行元气、运行水液的作用。

奇恒之腑包括脑、髓、骨、脉、胆、女子胞。脑为“髓海”，主宰人体的生命活动、精神意识和感觉运动。髓有骨髓、脊髓和脑髓之分，能滋养骨骼和脑。骨具有支撑人体、保护内脏等作用。脉是血液运行的通道。胆虽属六腑，但又因其内藏清净之液，与其他腑有所不同，故又属奇恒之腑。女子胞是女性生殖器官，主月经和孕育胎儿。