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水性凝胶剂的一般制法为水溶性药物先溶于部分水或甘油中，必要时加热以加速溶解；处方中其余成份按基质配制方法制成水性凝胶基质；将药物溶液与水性凝胶基质混合并加水至全量即得。对于不溶于水的药物，可先用少量水或甘油研细、分散后，再加入基质中搅匀即得。