B细胞和T细胞免疫应答是机体适应性免疫应答的重要组成部分，二者存在多方面的差异。

在识别抗原方面，B细胞可以直接识别天然抗原表位，无需抗原提呈细胞的处理和提呈，能够识别蛋白质、多糖、脂类等多种不同类型的抗原。而T细胞不能直接识别天然抗原，只能识别经抗原提呈细胞加工处理后，与主要组织相容性复合体（MHC）分子结合的抗原肽，并且T细胞主要识别蛋白质抗原。

活化过程也有所不同。B细胞活化需要双信号，第一信号是B细胞抗原受体（BCR）识别抗原，第二信号主要由Th细胞表面的共刺激分子与B细胞表面相应配体相互作用产生。T细胞活化同样需要双信号，第一信号是T细胞抗原受体（TCR）识别抗原肽 - MHC复合物，第二信号由T细胞和抗原提呈细胞表面的共刺激分子相互作用提供。而且T细胞活化还需要细胞因子的参与来维持和调节其活化过程。

免疫效应方面，B细胞活化后分化为浆细胞，分泌抗体，通过抗体发挥中和作用、调理作用、补体激活作用等，主要参与体液免疫，可有效清除细胞外病原体及其毒素。T细胞则可分化为不同亚群，如辅助性T细胞（Th）可分泌细胞因子调节免疫应答，细胞毒性T细胞（CTL）能直接杀伤靶细胞，主要参与细胞免疫，在清除被病原体感染的细胞、肿瘤细胞等方面发挥重要作用。

记忆细胞形成上，B细胞和T细胞在免疫应答过程中都能形成记忆细胞，但B细胞记忆细胞再次遇到相同抗原时可迅速分化为浆细胞产生大量抗体；T细胞记忆细胞再次活化后能快速发挥效应功能，增强细胞免疫应答。

从免疫应答的时间来看，B细胞介导的体液免疫在初次接触抗原后有一定的潜伏期，一般数天后才产生抗体，但再次应答时反应迅速且抗体水平高。T细胞介导的细胞免疫在抗感染免疫中发挥作用相对较慢，但对于控制细胞内感染等有重要意义。