中枢免疫器官和外周免疫器官在机体的免疫系统中都发挥着重要作用，但它们在多个方面存在明显区别。

从定义和组成来看，中枢免疫器官是免疫细胞发生、分化、发育和成熟的场所，包括骨髓和胸腺。骨髓是各类血细胞和免疫细胞发生的场所，也是B淋巴细胞分化成熟的部位；胸腺是T淋巴细胞分化、发育、成熟的场所。而外周免疫器官是成熟淋巴细胞定居的场所，也是淋巴细胞对外来抗原产生免疫应答的主要部位，主要包括淋巴结、脾和黏膜相关淋巴组织等。

在功能方面，中枢免疫器官侧重于免疫细胞的生成和成熟。骨髓能够产生造血干细胞，它可以分化为各种血细胞，如红细胞、白细胞和血小板等，同时还是B细胞发育成熟的关键部位。胸腺则为T细胞的成熟提供微环境，促使T细胞获得功能性T细胞受体，并对自身抗原产生耐受性。外周免疫器官主要负责免疫应答的启动和执行。淋巴结可以过滤淋巴液，捕捉其中的病原体等抗原物质，启动免疫应答；脾是人体最大的淋巴器官，能过滤血液，对血源性抗原产生免疫应答；黏膜相关淋巴组织覆盖了身体与外界接触的黏膜表面，在局部免疫防御中发挥重要作用，如防止病原体通过黏膜入侵机体。

在发生和发育时间上，中枢免疫器官发育较早。胚胎时期，骨髓和胸腺就开始发挥作用，为免疫系统的建立奠定基础。外周免疫器官随着个体的生长逐渐发育完善，在出生后不断接受抗原刺激，功能逐渐增强。

从结构特点来讲，中枢免疫器官有其独特的微环境。骨髓中有造血诱导微环境，为造血干细胞的增殖和分化提供必要的信号和支持；胸腺有皮质和髓质之分，皮质中主要是未成熟的T细胞，髓质中有成熟的T细胞和胸腺小体等结构。外周免疫器官则具有不同的组织结构以适应其功能。淋巴结有皮质、副皮质区和髓质，不同区域分布着不同类型的淋巴细胞；脾有白髓、红髓和边缘区，白髓主要是淋巴细胞聚集的部位，红髓则与血液过滤和血细胞储存有关。

综上所述，中枢免疫器官和外周免疫器官在组成、功能、发育时间和结构特点等方面都存在显著差异，但它们相互协作，共同维持机体的免疫平衡和稳定。