链球菌属是一类常见的革兰阳性球菌，在医学微生物学中，链球菌属主要有以下几种分类方式：

按溶血现象分类是较为常用的分类方法之一。可分为甲型溶血性链球菌，这类细菌在血琼脂平板上，菌落周围会形成1 - 2mm宽的草绿色溶血环，故又称草绿色链球菌。其溶血环中的红细胞并未完全溶解，主要是因为细菌产生的过氧化氢使血红蛋白氧化成正铁血红蛋白而呈现绿色。甲型溶血性链球菌多为条件致病菌，在一定条件下可引起亚急性细菌性心内膜炎等疾病。

乙型溶血性链球菌能产生强烈的溶血素，在血琼脂平板上，菌落周围形成2 - 4mm宽、界限分明、完全透明的无色溶血环。这类细菌致病力强，可引起多种化脓性炎症、猩红热等疾病。根据细胞壁多糖抗原的不同，乙型溶血性链球菌又可分为A - H、K - V等20个群，其中A群链球菌是引起人类感染最常见的病原菌。

丙型链球菌不产生溶血素，在血琼脂平板上菌落周围无溶血环，一般不致病，常存在于乳类和粪便中。

按抗原结构分类，主要是根据链球菌细胞壁中多糖抗原的不同进行分类，可分为A - H、K - V等20个群。对人致病的链球菌菌株，90%左右属A群，同一群的链球菌又可根据表面蛋白质抗原的不同，分为若干型，如A群根据M抗原不同可分成约100个型。

此外，还可根据对氧的需求进行分类，分为需氧、兼性厌氧和厌氧性链球菌。需氧和兼性厌氧链球菌对人致病，而厌氧性链球菌是口腔、消化道、泌尿生殖道的正常菌群，在特定条件下可引发内源性感染。