肝素钠对动脉壁的保护作用来自许多方面，现综合归纳为以下两部分：

　　1、进入体内的肝素能选择性地大量分布在血管壁，并在局部存留较长的时间，发挥以下的作用：①能与多种血管活性物质以及某些病毒和毒素等结合，防止它们损伤血管壁；②能避免血小板黏附、聚集和释放损伤血管内膜的有害物质；③能中和受损内膜和中层组织释放的血栓活性物质，增强内膜表面的抗凝血酶，发挥局部抗血栓作用；④能降低血管内膜的通透性，减少脂蛋白的透入；⑤能抑制损伤处平滑肌细胞的增殖移行。

　　2、在血液中的肝素可发挥以下作用：①调整血脂代谢，增加脂蛋白酯酶活性，降低极低密度脂蛋白和低密度脂蛋白，升高高密度脂蛋白，使血液黏滞度降低，改善供氧和微循环；②纠正高凝血状态，增加纤溶酶原激活物，促进纤溶；③抑制免疫复合物的形成和过高的补体活性；④保护动脉壁药物的范围很广，抗高血压药、抗过敏药、抗血小板药和脂质代谢药等，医学`教育网搜集整理都有一定的保护动脉壁作用，但是都非主要作用，目前临床上仅有肝素具有较突出的保护动脉壁效应。