《内经》主要分为《素问》和《灵枢》两部分。

《素问》之名，最早见于张仲景《伤寒杂病论·序》，其含义有多种解释。“素”有平素、本质之意，“问”即询问，可理解为对人体生命活动基本规律和医学基础理论的问答探讨。《素问》涵盖了丰富的医学内容，包括阴阳五行学说、藏象学说、经络学说、病因病机学说、诊法学说、治则治法等。在阴阳五行学说方面，它强调人体与自然界的阴阳平衡和五行生克关系，如“阴阳者，天地之道也，万物之纲纪，变化之父母，生杀之本始，神明之府也”，指出阴阳是宇宙万物的基本规律，人体的生理病理也遵循这一规律。藏象学说则详细阐述了五脏六腑的生理功能和相互关系，为中医认识人体生理结构和功能提供了理论框架。病因病机学说中，对外感六淫、内伤七情等致病因素进行了分析，解释了疾病的发生、发展和变化机制。

《灵枢》又称《九卷》《针经》等。“灵”有神灵、灵活之意，“枢”有枢纽、关键之意，强调了其在针刺治疗和人体生命活动调节中的重要地位。《灵枢》侧重于经络腧穴理论、针刺方法和针灸治疗等内容。它系统地论述了经络的循行、分布、功能以及与脏腑的联系，为针灸临床提供了理论依据。书中详细记载了各种针刺手法，如提插补泻、捻转补泻等，还对不同疾病的针灸治疗原则和方法进行了探讨。同时，《灵枢》也涉及到一些解剖学知识和养生保健理论，对中医的发展产生了深远影响。

《素问》和《灵枢》相互补充、相互印证，共同构成了《内经》的完整体系，是中医理论的奠基之作，对后世中医的发展起到了至关重要的作用。