乙肝病毒存在三对抗原抗体系统，即表面抗原（HbsAg－俗称澳抗）和表面抗体（抗-HBs）、e抗原（HBeAg）和e抗体（抗-HBe）、核心抗原（HBcAg）和核心抗体（抗-HBc），因核心抗原主要存在于肝细胞中，血清中不能表达，检测困难，故只能检测二对半而不能检测三对，所以称为二对半。当五项全部阴性，说明没有感染过乙肝，属于健康者，如出现抗-HBs阳性，或抗-HBs和抗-HBc阳性，上述情况可能是注射过乙肝疫苗或感染乙肝后治愈而出现的保护性抗体。
乙肝病毒“大三阳”（指HBsAg、HBeAg、抗-HBc阳性）、乙肝病毒“小三阳”（指HBsAg、抗-HBe、抗-HBc阳性）或乙肝病毒1、5阳（指HBsAg、抗-HBc阳性）。这三种情况临床多见，并不能表示肝功能及病情的严重程度。“大三阳”说明乙肝病毒在体内复制活跃，传染性强。“小三阳”、“1、5阳”说明体内乙肝病毒复制明显降低，传染性弱。但如果HBV－DNA呈阳性，则有可能存在病毒变异，仍有较强的传染性。如果有上述几种情况，肝功能正常，即属于乙肝病毒携带者。
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