在胚胎发育过程中，咽囊共有5对，每对咽囊会分别对应发育形成不同的重要结构。

第一对咽囊：它会向外侧膨大形成咽鼓管，其末端会膨大形成中耳鼓室。而鼓室与外耳道之间的鼓膜，其内侧部分也和第一咽囊的发育相关。并且，第一咽囊的腹侧份会参与形成扁桃体窝上部。这一系列结构对于听觉功能的实现至关重要，咽鼓管可以调节中耳内的压力，使其与外界大气压保持平衡，保证鼓膜的正常振动，从而实现声音的有效传导。

第二对咽囊：主要参与形成腭扁桃体的上皮和隐窝。腭扁桃体是人体免疫系统的一部分，位于口咽部两侧，能够产生淋巴细胞和抗体，对进入口腔和咽部的病原体起到一定的防御作用，在儿童时期其免疫功能更为明显。

第三对咽囊：其背侧份会分化发育成下一对甲状旁腺。甲状旁腺主要分泌甲状旁腺激素，该激素对于维持人体血钙和血磷的平衡起着关键作用，它可以促进骨钙释放进入血液，同时促进肾小管对钙的重吸收，减少钙的排泄。而第三对咽囊的腹侧份则会形成胸腺原基，最终发育成胸腺。胸腺是T淋巴细胞分化、发育和成熟的重要场所，在机体的细胞免疫功能中发挥着核心作用。

第四对咽囊：背侧份会发育成上一对甲状旁腺，同样参与钙磷代谢的调节。

第五对咽囊：一般会形成后鳃体，后鳃体的细胞会迁移到甲状腺内，分化为滤泡旁细胞，也称为C细胞。C细胞能够分泌降钙素，与甲状旁腺激素相互拮抗，共同调节血钙水平，当血钙浓度升高时，降钙素分泌增加，促进钙沉积于骨，从而降低血钙水平。

综上所述，咽囊在胚胎发育过程中对于人体多个重要器官和结构的形成起着决定性作用，这些结构在人体的生理功能中都有着不可或缺的地位。