两囊肿治疗方法是否一样不能一概而论，需要根据囊肿的具体类型、部位、大小、患者的全身状况等多方面因素综合判断。

首先，不同类型的囊肿治疗方法可能存在差异。例如，牙源性囊肿和非牙源性囊肿，牙源性囊肿如根尖周囊肿，多是由于根尖周的炎症刺激引起。对于较小的根尖周囊肿，通常可先进行根管治疗，通过消除根尖周的炎症，部分囊肿可能会逐渐减小甚至消失。若囊肿较大，根管治疗效果不佳时，则可能需要进行根尖手术，切除囊肿并处理根尖病灶。而非牙源性囊肿，如鼻腭管囊肿，位于切牙管内，一般需要通过手术将囊肿完整摘除。

其次，囊肿的部位也会影响治疗方法。如果囊肿位于重要的解剖结构附近，如靠近神经、血管等，手术治疗时需要特别谨慎，可能需要采用更精细的手术方式以避免损伤这些重要结构。比如下颌骨的含牙囊肿，如果囊肿靠近下牙槽神经，手术时就需要尽量保护神经，必要时可能需要分块摘除囊肿。

再者，囊肿的大小也是决定治疗方法的关键因素之一。较小的囊肿可能通过相对简单的保守治疗或小型手术就能解决问题。而较大的囊肿，由于其范围广，可能需要更复杂的手术，甚至可能需要进行颌骨的部分切除和修复。

此外，患者的全身状况也不容忽视。如果患者存在严重的全身性疾病，如心脏病、糖尿病等，手术风险会增加，在治疗时需要先对这些基础疾病进行评估和控制，甚至可能会影响到是否能够进行手术治疗。

综上所述，两囊肿治疗方法不一定一样，需要综合考虑多种因素来制定个性化的治疗方案。