正黏病毒和副黏病毒是两类不同的病毒，它们在多个方面存在区别。

在病毒形态方面，正黏病毒一般呈球形或丝状，病毒颗粒相对较小，直径约为80 - 120纳米；而副黏病毒多为球形，形态大小差异较大，直径通常在150 - 300纳米，比正黏病毒大。

基因组结构上，正黏病毒的基因组为分节段的单股负链RNA，一般有8个节段。这种分节段的特点使得病毒在复制过程中容易发生基因重配，导致新的病毒株出现，这也是流感病毒容易发生抗原转变的原因。副黏病毒的基因组是单股负链RNA，但为不分节段的完整一条，相对较为稳定，抗原性变异频率低于正黏病毒。

抗原特性上，正黏病毒的表面抗原如血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）具有高度变异性，这使得人体免疫系统难以对其产生持久有效的免疫保护，所以正黏病毒引起的疾病如流行性感冒容易反复流行。副黏病毒的抗原性相对稳定，例如麻疹病毒、腮腺炎病毒等，感染后人体可获得较为持久的免疫力。

致病特点方面，正黏病毒主要引起流行性感冒，具有传播速度快、发病率高、容易引起大流行等特点，严重时可导致肺炎等并发症甚至危及生命。副黏病毒可引起多种疾病，如麻疹病毒引起麻疹，腮腺炎病毒引起流行性腮腺炎，呼吸道合胞病毒引起婴幼儿呼吸道感染等，不同的副黏病毒致病表现各有特点，但一般不像正黏病毒那样容易引发大规模的全球性流行。

培养特性上，正黏病毒可以在鸡胚中良好生长，常用于病毒的分离和培养。副黏病毒有些可以在鸡胚中生长，但部分病毒更适合在组织培养细胞中培养，如呼吸道合胞病毒常用人胚肾细胞等进行培养。