含硫氨基酸主要包括甲硫氨酸（蛋氨酸）、半胱氨酸和胱氨酸，它们在人体内经过一系列复杂的代谢过程会产生多种重要的代谢产物。

甲硫氨酸在代谢过程中具有重要作用。甲硫氨酸首先通过甲硫氨酸循环，与ATP反应生成S - 腺苷甲硫氨酸（SAM），SAM是体内最重要的甲基供体，可参与多种物质的甲基化反应，如DNA、RNA、蛋白质等生物大分子的甲基化修饰，这对于基因表达调控、蛋白质功能调节等生理过程至关重要。在甲硫氨酸循环中还会生成同型半胱氨酸，同型半胱氨酸若在体内堆积，会对血管内皮细胞产生损伤，增加动脉粥样硬化等心血管疾病的发生风险。

半胱氨酸和胱氨酸可以相互转化。半胱氨酸是合成谷胱甘肽的重要原料，谷胱甘肽是一种具有重要生理功能的三肽，它具有抗氧化作用，能够保护细胞免受自由基的损伤，维持细胞内的氧化还原平衡。半胱氨酸还可以通过脱硫氢生成丙酮酸、氨和硫化氢，硫化氢虽然是一种有毒气体，但在体内作为一种气体信号分子，参与调节血管舒张、神经传导等生理过程。此外，半胱氨酸在体内还可代谢生成牛磺酸，牛磺酸对婴幼儿的生长发育、视网膜功能维持等具有重要意义。

含硫氨基酸在代谢过程中还会生成硫酸根。这些硫酸根一部分以无机盐的形式随尿液排出体外，另一部分则可与一些物质结合形成硫酸酯，如类固醇激素、酚类化合物等与硫酸根结合后，其水溶性增加，有利于它们在体内的运输和排泄。总之，含硫氨基酸的代谢产物在人体的生理和病理过程中都发挥着重要作用。